Инженер-микробиолог осуществляет контроль качества воды по микробиологическим, вирусологическим, паразитологическим показателям в местах водозабора, на этапах ее обработки, перед поступлением в сеть и в самой водораспределительной сети. Осуществляет контроль за состоянием лабораторного оборудования и его работой и т.д.